本发明属于生物技术领域,具体涉及一种与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008、引物及应用。所述syau3008的核苷酸序列为SEQ ID NO.1或者为SEQ ID NO.2。所述分子标记syau3008的变异稳定存在于植株中,避免了因为复杂性和特异性导致的后续分析模糊。特异引物syau3008‑F/R检测含有QS_B3.1抗病基因,无论该基因为纯合还是杂合都表现出抗病,为今后大白菜抗病育种提供了抗病基因辅助选择的分子标记。通过本发明的特异引物syau3008‑F/R可对待测植株进行苗期鉴定,检测成本低、准确性高,大大提高育种效率,缩短育种进程。